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Zipaquirá es una de las ciudades más antiguas de la República, sus orígenes anteceden a la época conquista. Los indígenas, pobladores primitivos, se ubicaron en la parte alta de la mina, en un lugar conocido como "Pueblo viejo" (hoy Santiago Pérez), aproximadamente 200 metros arriba respecto al sitio que ocupa la ciudad actualmente. Zipaquirá no ha tenido fundación, pues existiendo ya en época anterior a la conquista, el 18 de Julio de 1600 fue erigida la "Villa de Zipaquirá", por el oidor don Luis Henríquez. Hacia el año 1605 queda como corregimiento de Zipaquirá, y como provincia autónoma en 1852.

Extensión: Zipaquirá posee una extensión aproximada de 197 kilómetros cuadrados  así: 8 kilómetros cuadrados  de la zona urbana y 189 kilómetros cuadrados de la zona rural.

Altura sobre el nivel del mar: La altitud del casco urbano del municipio de Zipaquirá sobre el nivel del mar es  de 2.650 metros.

Clima: Zipaquirá tiene una temperatura media de 14º centígrados. En los meses de sequía y verano sube a 16º centígrados  y se han registrado excepcionalmente olas transitorias de calor  hasta de 20º centígrados.

Relieve: Topográficamente esta sección territorial está dividida en dos  regiones bien definidas:
1.- Región plana situada al oriente, rica en pastos aprovechados para la ganadería.
2.- Región montañosa situada al occidente, (rica en minerales) entre la que se destacan entre otras las siguientes alturas:
a.- El cerro del Zipa bajo el cual se encuentra la mina y su monumental templo subterráneo de sal, el Páramo de Guerrero rico en yacimientos de carbón, la serranía de Ventalarga con Pantano Redondo.
b.- El cerro del Calzón.

Hidrografía: Con excepción de muy pocos riachuelos  que nacen al suroeste,  provienen principalmente de las hoyas de las montañas situadas al norte, asiento del Páramo de Guerrero, Páramo Alto y Pantano Redondo.
La ramificación de la cordillera occidental, da nacimiento a importantes quebradas de apacible caudal. Al este, es poco rica la hidrografía por ser esta la parte plana del municipio y la más seca. Principales Ríos de Zipaquirá: Al norte: El río Neusa, el cual nace en el Páramo de Guerrero y atraviesa la Vereda de Riofrío con dirección nordeste. Al sur: El Río Frío
Al oriente: El río Tibitó Al occidente: El Juratena
La parte plana del municipio la riegan los ríos Neusa y Tibitó (que después se llama Funza o Bogotá). Entre las quebradas, merecen especial mención:

Al norte: Alizal, Versalles, Quiroga, Pescadero, La Calera, Los Coclíes y el Tejar.
Al oriente: Quebrada Honda, Del Mortiño, Los Laureles, (La Fuente), Chitagá, La Amarilla,  La Toma y Susagua.
Al occidente: Pantano largo, El Carrizal, Rodamontal, la Arteza, El Rionegro o Tosagua, llamado en su nacimiento La Tibia y El Tejar o Uricia.
Al sur: El Hornillo, El Gavilán o Chitagua, Aguaclara, Guabal, la Colorada y el Salitre.

Nota: Tomada de Monografia escrita por el zipaquireño Carlos Riaño.

Límites del municipio: Zipaquirá está situada en el centro de la República de Colombia Departamento de Cundinamarca. Zipaquirá limita:
Por el norte con el municipio de Cogua
Por el sur con los municipios de Tabio, Cajicá y Tocancipá      
Por el occidente con los municipios de Subachoque y Pacho y
Por el oriente con los municipios de Tocancipá, Nemocón y Cogua